O sistema de governança do Parque Tecnológico da UFRJ consiste em uma combinação de mecanismos de governança e gestão que tem como objetivo principal assegurar, de forma participativa, a execução plena de sua missão.

Os instrumentos de referência que balizam as ações são:

(i) Regulamento aprovado pelo Conselho Universitário da UFRJ em 1997;
(ii) Plano estratégico do Parque Tecnológico da UFRJ 2016-2045;
(iii) Regulamento de uso e ocupação do solo;
(iv) Editais de seleção pública (incluindo critérios de seleção)
(v) Contratos.

O Conselho Diretor é a instância máxima de decisão do Parque. Além de indicar e aprovar o Diretor Executivo e seu respectivo plano de gestão, o Conselho julga as empresas candidatas ao Parque e avalia permanentemente os diferentes impactos gerados pela atuação do Parque. A Direção Executiva é responsável pelas decisões estratégicas e desempenho em termos de sustentabilidade econômica, ambiental e social do Parque. O mandato é de quatro anos e o pré-requisito principal é que o diretor eleito seja servidor da UFRJ.

Para que o Parque consiga cumprir a sua missão, existem outros dois mecanismos de apoio à governança: (i) Comitê Gestor de Articulações da UFRJ – Empresa/Parque Tecnológico; e (ii) Comitê Consultivo de Arquitetura e Urbanismo. O primeiro apoia o Parque definindo diretrizes de priorização de ações e iniciativas que sejam do interesse da UFRJ e que contem com o apoio econômico-financeiro das empresas instaladas no Parque. O comitê também é responsável pela avaliação dos investimentos feitos na UFRJ a título de contrapartida pelas empresas instaladas no Parque Tecnológico, conforme previsto nos respectivos contratos de concessão. Esse comitê é formado apenas por servidores da UFRJ, visando assegurar os interesses da Universidade. Já o comitê consultivo de arquitetura e urbanismo define os parâmetros de uso do solo e analisa os projetos das empresas de acordo com esses parâmetros. É um comitê de composição mista, com representantes de instâncias da UFRJ e do Parque.